Начало игры в убежище 101, перед миссией про "транквилити лейн" ГГ похищают супермутанты.
ГГ везут на базу мутантов*(Которая находиться не далеко от Вегаса) но он убегает, после побега гг идет по пустыне где его подбирает караван, ну или его спасают НКР. После чего сбрасываются все навыки, а вещи еще в самом начале отняли мутанты и что бы их вернуть надо еще раз попасть на эту базу..
После старта в Вегасе, начинаются флешбеки и гг вспоминает мутантов, убежище, отца..
* - можно перевалочный пункт супермутантов.