Решение проблемы 2(Хейс убегает на 2 этаж и зависает) с помощью консоли. Нужно зайти за уничтоженную стену и телепортировать Хейса к игроку с помощью консоли.
1. Надо выяснить id Хейса, подходим к нему, открываем консоль и кликаем по нему. Вверху экрана появится его имя, нужно запомнить значение в круглых скобках.(У меня это 1е86609с).
2. Заходим за взорванную стену, до спуска вниз.
3. Пишем в консоли
prid 1е86609с
moveto player
После второй команды появится Хейс, а его команда прибежит за ним.
UPD: О'Нила можно починить таким же способом(когда пойдёт к заводу ядер колы), переместить его к себе за стену которую взрывали в самом начале. У меня он сначала рванулся обратно, а потом побежал на выход из Ген-тек.