Все нормально тут, вода чистая. В итоге выяснил, что виновата опция bWaterVariation в конфиге, которая отвечает за вариативность добавленной воды. А я думал, что эта опция отвечает за появление в игре различных новых типов воды, а она отвечает именно за изменение Чистой ванильной и Грязной ванильной воды, когда те подгружаются в игре. Т.е. даже с этой выключенной опцией новые типы воды из мода будут появляться, но там где изначально должна появляться ванильная вода (как в твоем случае), эта ванильная вода и появится)
Короче, в конфиге надо выставить:
bWaterSourceLimit=0
bWaterVariation=0
Магнум, советую поставить в сборке эти опции по умолчанию - они реально стремные)