Протестировал с RA-Redesign, баг с глазами пропал сам собой, посмотрев бса архив RA-RedesignHD, понял что в нем косяк, а точнее в FCO. При его использовании происходит баг с глазами только у базовых рас (глаза бонусных в полном порядке), но как писал выше данная проблема у меня возникла при одновременном использовании RA-RedesignHD и SFW-BSA Optimization Project. Может кто сделает патч для совместимости, просто Old Vault Boy сделал хорошую работу по повышению графики, без захламления папки Data, а так придется новые текстуры отдельно в папки пихать из-за данного бага с глазами.