Так они сами по себе должны оставаться, как пустые ланчбоксы. В шелтере не знаю, не играл, но в четвертом фоле примерно так же сделано, правда там лишь градации "мусора" (хотя чаще всего реально мусор), а не броня и не оружие. А с самой коробкой потом можно хоть еду, хоть крышкомину делать.
Но если допустим не все ланчбоксы, а какие-то определенные, да действительно лишь с перком "Дикая пустошь", то вполне нормально будет. Естественно это должны быть раскиданные по пустоши коробочки, а не от торговцев.