Как оказалось, виноват Project Nevada. Если конкретней, то плагин Project Nevada - Equipment.esm перезаписывает переменную BrotherhoodOfSteelWeaponBigGun [LVLI:000182AD]
Фикс выше тоже эту переменную перезаписывает, и Братство Стали стали попадаться вообще с 9-мм пистолетом)
Решением будет, наверно, заменить эту переменную в Project Nevada - Equipment.esm на ту, что у оригинала FalloutNV.esm
Если пойдет, то вот фикс
BrotherhoodOfSteelWeapon.esp